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圆二色谱 (Circular Dichroism) 单位转换方法 Unit conversion method of Circular Dichroism

浏览量:时间:2020-09-10

 

【光谱实验室:陈中博士 转载】

【仪器设备:圆二色光谱仪

【地点:4号楼220室 光谱实验室】


 

由于历史原因,圆二色谱(Circular Dichroism,简称CD) 的单位被定义为ellipticity (椭圆率),对于蛋白质来说文献中通常都使用mean residue ellipticity [θ](化合物的亦作molar ellipticity [θ])表示,单位为deg.cm2.dmol-1。而我们在实验中测试圆二色谱时得到的CD谱数据一般都是以毫度mdeg表示(Y轴),其对应的横轴(X axis)为波长nm。很多人多次束手无策,在不同的CD单位之间不知怎么换算。更有甚者,甚至把这两个数据混为一谈。

Molar ellipticity [θ]
mdeg转换方法

[θ]=deg.cm2.dmol-1
根据Beer-Lambert law 有:
mdeg = [θ]. l.c
[θ]=mdeg/(l.c )
其中,l 为光径(mm)、c 为样品浓度(mM)。
于是单位之间可以这样转换:
mdeg/(mm. mM) =(1/1000) deg/(mm.mM)= (1/1000).deg/ (1/10 cm. 1/1000000 mole/cm3)= (1/1000).deg/ (1/10000000 mole/cm2)= (1/1000).deg/ (1/1000000 dmole/cm2)= (1/1000).deg/ (1/1000000 dmole/cm2)= 1000/(1/1000000) deg.cm2.dmol-1= 1000 deg.cm2.dmol-1
也就是说,用公式[θ]=mdeg/(l.c ) 计算出的值最后再乘以1000即可转换为deg.cm2.dmol-1

再通俗点,把实验中测定得到的mdeg值乘以1000除以光径(mm)再除以浓度(mM) 所得的值的即为molar ellipticity [θ](单位deg.cm2.dmol-1
 
对于蛋白质,使用的是mean residue ellipticity。由于mean residue molecular weight= protein formula weight/number of residues,故最后还应把通过上述方法计算出的数值再除以蛋白质残基数。

摩尔圆二色性(molar circular dichroism)与摩尔椭圆率(molar ellipticity
摩尔圆二色性为摩尔消光系数的差值(delta epsilon),即:
Δε = εLCP- εRCP
在分子模拟中通过高斯理论计算CD光谱时,得到的结果通常是以摩尔圆二色性Δε 表示。Δε 与摩尔椭圆率(molar ellipticity[θ]之间的转换公式为:
[θ]=3298.2 Δε

 

原载于 散人笔记

原文地址 http://www.eryi.org/blog/post/circular-dichroism-units-conversion.html